Salah satu proyek yang dikerjakan WSKT di IKN yaitu pembangunan sekretariat presiden dan sejumlah fasilitas pendukung. Proyek yang bernilai Rp 1,35 triliun tersebut sepenuhnya dikerjakan WSKT dan ditargetkan selesai pada semester kedua 2024.
WSKT juga menjadi bagian dalam pengerjaan proyek pembangunan Tol Ruas 5A: Simpang Tempadung – Jembatan Pulau Balang. Proyek ini dikerjakan secara joint venture bersama PT Nindya Karya (Persero) dan PT Modern Widya Tehnical dengan total nilai Rp 2,2 triliun.
Beberapa proyek IKN lainnya yang akan dikerjakan oleh WSKT yaitu pembangunan jalur pekerjaan atau jalan logistik pembangunan Ruas 4 Lingkar Sepaku, pembangunan gedung dan kawasan Kementerian Koordinator Paket 3, pembangunan gedung dan kawasan Kementerian Koordinator Paket 4 serta pembangunan Instalasi Pengolahan Air Limbah (IPAL) 1, 2, 3.