Sebelum melakukan endoskopi pasien harus puasa total minimal 6-8 jam sebelum pemeriksaan endoskopi (Gastroscopy), puasa makan dan minum 6 jam, malam hari sebelum pemeriksaan diberikan obat pencahar ( fleet phosposoda/garam inggris), pagi hari sebelum tindakan pasien diberikan fleet enema, dianjurkan minum lebih banyak 2-3 liter pada malam hari sebelum pemeriksaan (Colonoscopy).Persiapan khusus akan diberikan  petugas pada pasien-pasien dengan penyakit penyerta seperti gagal ginjal (CKD), Gula darah Tinggi (DM), Penyakit jantung dan lainnya.

Setelah tindakan endoskopi pasien akan dipuasakan sekitar 1 jam setelah pemeriksaan. Pasien juga tidak di perbolehkan mengendarai kendaraan sendiri, sebaiknya di damping keluarga dan hindari aktivitas berat.